साध्वी प्रज्ञा सिंह ठाकुर का विवाद के साथ रिश्ता चोली-दामन का है। पहले वह महात्मा गांधी के हत्यारे  नाथूराम गोडसे को देशभक्त बताकर चर्चा बटोर चुकी हैं। वहीं कभी उन्होंने गो मूत्र के औषधीय लाभ के बारे में बोलकर लोगों का ध्यान अपनी ओर खींचा था।